More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3029 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  100 
 
 		 929 aa  1893    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.39 
 
 		 921 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 		 930 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.81 
 
 		 957 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.34 
 
 		 921 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.01 
 
 		 927 aa  489  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.89 
 
 		 934 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.3 
 
 		 952 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.83 
 
 		 944 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.51 
 
 		 956 aa  466  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.08 
 
 		 934 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.19 
 
 		 934 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.89 
 
 		 921 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.69 
 
 		 960 aa  452  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.26 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.26 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.83 
 
 		 934 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.83 
 
 		 934 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.83 
 
 		 934 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 934 aa  446  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 934 aa  446  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.94 
 
 		 934 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.58 
 
 		 929 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.87 
 
 		 909 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  32.97 
 
 		 838 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  33.66 
 
 		 851 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  33.57 
 
 		 822 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  33.38 
 
 		 729 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  31.57 
 
 		 832 aa  362  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  31.3 
 
 		 843 aa  353  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.58 
 
 		 674 aa  350  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.92 
 
 		 659 aa  346  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  31.16 
 
 		 681 aa  346  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  31.98 
 
 		 876 aa  344  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  32.44 
 
 		 840 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  30.61 
 
 		 846 aa  343  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  32.38 
 
 		 843 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  31.09 
 
 		 830 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  33.43 
 
 		 646 aa  337  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.54 
 
 		 643 aa  336  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  30.65 
 
 		 830 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.42 
 
 		 646 aa  335  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.89 
 
 		 644 aa  334  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.35 
 
 		 658 aa  332  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  32.7 
 
 		 669 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  32.56 
 
 		 640 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.45 
 
 		 639 aa  332  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  32.7 
 
 		 640 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  32.55 
 
 		 669 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  32.16 
 
 		 664 aa  330  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.19 
 
 		 707 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  31.27 
 
 		 646 aa  327  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.26 
 
 		 646 aa  327  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  32.46 
 
 		 647 aa  326  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34.32 
 
 		 641 aa  326  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34.32 
 
 		 641 aa  326  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  32.11 
 
 		 639 aa  325  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.53 
 
 		 640 aa  325  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  31.47 
 
 		 661 aa  323  9.000000000000001e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.93 
 
 		 709 aa  323  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.02 
 
 		 639 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.92 
 
 		 978 aa  321  3.9999999999999996e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  31.29 
 
 		 649 aa  320  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.78 
 
 		 651 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  30.56 
 
 		 634 aa  318  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  30.56 
 
 		 634 aa  317  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  30.56 
 
 		 634 aa  317  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  31.74 
 
 		 633 aa  317  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  30.86 
 
 		 634 aa  316  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  30.81 
 
 		 636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  30.87 
 
 		 636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  30.87 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  30.87 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  31.13 
 
 		 659 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  31.3 
 
 		 659 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  30.87 
 
 		 636 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  31.82 
 
 		 647 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  31.65 
 
 		 650 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  32.04 
 
 		 754 aa  313  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  31.65 
 
 		 650 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  31.17 
 
 		 725 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  31.25 
 
 		 674 aa  313  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  31.74 
 
 		 641 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  32.69 
 
 		 636 aa  312  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  32.99 
 
 		 641 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.26 
 
 		 662 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  32.68 
 
 		 641 aa  311  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  32.44 
 
 		 644 aa  311  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  30.78 
 
 		 636 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.42 
 
 		 651 aa  310  8e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  30.78 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.78 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  30.78 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  30.78 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  30.78 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  30.78 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  30.78 
 
 		 636 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  31.97 
 
 		 698 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  31.76 
 
 		 653 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  32.94 
 
 		 664 aa  308  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>