More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2986 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  100 
 
 		 775 aa  1570    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.87 
 
 		 1247 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  34.66 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.27 
 
 		 330 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.97 
 
 		 323 aa  91.3  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  31.34 
 
 		 440 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.27 
 
 		 555 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  28.34 
 
 		 315 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  28.57 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.87 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  26.58 
 
 		 314 aa  83.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  35.26 
 
 		 437 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.11 
 
 		 1103 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  30.1 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  35.33 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  33.51 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  30.33 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  29.83 
 
 		 465 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  31.7 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  31.7 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.71 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  28.51 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  35.29 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  27.61 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  27.14 
 
 		 778 aa  78.2  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  28.19 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  30.62 
 
 		 466 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  23.93 
 
 		 783 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  29.39 
 
 		 466 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  30.62 
 
 		 466 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  29.39 
 
 		 466 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.64 
 
 		 407 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  34.71 
 
 		 647 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  29.86 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  34.67 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  30.37 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  30.14 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  30.35 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  31.58 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  28.68 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.53 
 
 		 944 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  28 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  27.99 
 
 		 947 aa  73.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  28.34 
 
 		 466 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  27.69 
 
 		 771 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  28.34 
 
 		 466 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  27.33 
 
 		 518 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  31.48 
 
 		 574 aa  73.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  31.58 
 
 		 524 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  30.57 
 
 		 625 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.42 
 
 		 674 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  28.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.09 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  32.35 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  30.95 
 
 		 462 aa  72  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  28.92 
 
 		 502 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.08 
 
 		 1147 aa  71.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  31.38 
 
 		 794 aa  70.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.9 
 
 		 338 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  30.81 
 
 		 747 aa  70.5  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  31 
 
 		 481 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  29.91 
 
 		 548 aa  70.5  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  36.72 
 
 		 457 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  32.54 
 
 		 312 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  29.89 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.89 
 
 		 584 aa  70.1  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  31.1 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  38.14 
 
 		 440 aa  70.1  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  24.4 
 
 		 799 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  26.94 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  31.84 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  32.76 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  37.5 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  29.29 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  28.27 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  28.27 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  33.72 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  28.63 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  29.28 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.66 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  34.44 
 
 		 616 aa  68.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.49 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  32.07 
 
 		 549 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  28.51 
 
 		 512 aa  67  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.85 
 
 		 1077 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  27.59 
 
 		 512 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.32 
 
 		 346 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  33.15 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  26.62 
 
 		 815 aa  67.4  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  35 
 
 		 335 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.16 
 
 		 282 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.88 
 
 		 563 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  28.51 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.32 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  29.13 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  36.54 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  28.28 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  31.82 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  31 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>