More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2972 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  48.55 
 
 
696 aa  680  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  54.23 
 
 
673 aa  751  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  53.42 
 
 
679 aa  738  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  46.81 
 
 
696 aa  643  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  49.34 
 
 
695 aa  693  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  46.81 
 
 
696 aa  646  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.99 
 
 
692 aa  703  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.91 
 
 
695 aa  681  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  47.18 
 
 
694 aa  657  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.76436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  46.08 
 
 
691 aa  654  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  57.5 
 
 
680 aa  781  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  45.04 
 
 
701 aa  644  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  45.93 
 
 
697 aa  639  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  56.97 
 
 
682 aa  771  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.72853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  47.68 
 
 
694 aa  636  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  54.71 
 
 
667 aa  752  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  100 
 
 
673 aa  1376  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  55.97 
 
 
670 aa  770  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  45.04 
 
 
701 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  43.87 
 
 
694 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  45.1 
 
 
697 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  45.45 
 
 
694 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  47.96 
 
 
682 aa  621  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  45.2 
 
 
697 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  45.66 
 
 
696 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  46.93 
 
 
683 aa  612  1e-174  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  45.04 
 
 
688 aa  612  1e-174  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  45.34 
 
 
689 aa  613  1e-174  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  45.69 
 
 
692 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  48.01 
 
 
686 aa  608  1e-172  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  47.43 
 
 
683 aa  605  1e-172  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  44.31 
 
 
691 aa  603  1e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  44.14 
 
 
692 aa  603  1e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  44.57 
 
 
692 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.23332e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  44.02 
 
 
697 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  44.54 
 
 
691 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  44.97 
 
 
697 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  44.18 
 
 
691 aa  589  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  43.34 
 
 
692 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  42.96 
 
 
692 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  44.41 
 
 
691 aa  586  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  42.96 
 
 
692 aa  582  1e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.05392e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  43.52 
 
 
690 aa  583  1e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  43.94 
 
 
689 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  42.42 
 
 
699 aa  579  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  43.34 
 
 
692 aa  577  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  43.11 
 
 
692 aa  578  1e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  42.23 
 
 
692 aa  577  1e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  42.42 
 
 
699 aa  577  1e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  42.9 
 
 
692 aa  578  1e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  42.24 
 
 
692 aa  577  1e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  42.37 
 
 
703 aa  578  1e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  5.74662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  42.23 
 
 
692 aa  577  1e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.39049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  43.36 
 
 
691 aa  575  1e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  43.24 
 
 
691 aa  574  1e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  41.65 
 
 
692 aa  572  1e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  41.75 
 
 
691 aa  574  1e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  41.94 
 
 
692 aa  574  1e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.10071e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  41.94 
 
 
692 aa  574  1e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.47757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  41.94 
 
 
692 aa  573  1e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  41.8 
 
 
692 aa  573  1e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  42.67 
 
 
692 aa  575  1e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  42.14 
 
 
697 aa  574  1e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  41.94 
 
 
692 aa  574  1e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  42.23 
 
 
692 aa  575  1e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  41.94 
 
 
692 aa  574  1e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.92838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  42 
 
 
697 aa  572  1e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  42 
 
 
697 aa  574  1e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  43.59 
 
 
689 aa  575  1e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  41.94 
 
 
692 aa  575  1e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.41 
 
 
691 aa  572  1e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  41.36 
 
 
692 aa  568  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.09677e-07  unclonable  1.50309e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  41.5 
 
 
698 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  41.89 
 
 
692 aa  571  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  43.33 
 
 
697 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  42.77 
 
 
698 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  42.52 
 
 
692 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  42.23 
 
 
691 aa  567  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.60019e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.62 
 
 
696 aa  568  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.37892e-05  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  41.88 
 
 
697 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.25345e-06  unclonable  1.75981e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  42.19 
 
 
698 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.06039e-05  unclonable  1.40529e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  41.01 
 
 
699 aa  564  1e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  42.48 
 
 
698 aa  563  1e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  7.23027e-08 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  40.94 
 
 
701 aa  563  1e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  42.19 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.38252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  41.13 
 
 
692 aa  564  1e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  42.19 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  41.37 
 
 
701 aa  564  1e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  41.01 
 
 
699 aa  564  1e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  42.19 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  42.19 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  5.05947e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  42.63 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  42.25 
 
 
694 aa  562  1e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  42.63 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.60004e-06  hitchhiker  1.4201e-08 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  41.26 
 
 
692 aa  564  1e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  42.27 
 
 
698 aa  564  1e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.55615e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  41.24 
 
 
688 aa  563  1e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  4.05339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  41.46 
 
 
691 aa  562  1e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  42.92 
 
 
690 aa  561  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>