More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2934 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
391 aa  784    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.24 
 
 
762 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.09 
 
 
508 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.17 
 
 
266 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.02 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.41 
 
 
635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 
575 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  33.99 
 
 
454 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.06 
 
 
160 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.56 
 
 
412 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.53 
 
 
450 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.73 
 
 
447 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.51 
 
 
160 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.3 
 
 
201 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  37.34 
 
 
241 aa  99.8  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.55 
 
 
306 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.67 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.62 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.84 
 
 
249 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  39.74 
 
 
358 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.34 
 
 
549 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.24 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.1 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.18 
 
 
283 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.61 
 
 
319 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.93 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  40.67 
 
 
462 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.55 
 
 
306 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  44.74 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.62 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.74 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  35.37 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.63 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.03 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.23 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  32.09 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  37.09 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.11 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  37.09 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.3 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.81 
 
 
128 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.81 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  54.93 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.11 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.53 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  40.16 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  36.42 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  38.89 
 
 
228 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.4 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.25 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  56.45 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  37.32 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  33.51 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  48.61 
 
 
242 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  29.79 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  38.33 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.04 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.26 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.25 
 
 
198 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.84 
 
 
77 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.38 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  52.38 
 
 
264 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92141  predicted protein  24.53 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.38 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  36.76 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  51.61 
 
 
228 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.56 
 
 
974 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.72 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  30.06 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.41 
 
 
269 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.22 
 
 
224 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.75 
 
 
182 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  49.21 
 
 
307 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  54.55 
 
 
292 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.72 
 
 
266 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.7 
 
 
305 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  56.45 
 
 
280 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.75 
 
 
792 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.33 
 
 
629 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.75 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  43.84 
 
 
225 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  46.58 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.76 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.77 
 
 
329 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.43 
 
 
193 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.62 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  31.85 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.97 
 
 
1089 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  54.84 
 
 
239 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.82 
 
 
321 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>