41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2932 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  822    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  54.5 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  55.15 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  35.75 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1604  hypothetical protein  34.71 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000195543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1040  hypothetical protein  30.54 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582207  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1836  hypothetical protein  30.96 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0721  hypothetical protein  28.97 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3885  hypothetical protein  29.43 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00209227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2369  hypothetical protein  27.71 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1833  hypothetical protein  25.13 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2569  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.3 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  23.16 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0534  hypothetical protein  26.25 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.67 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.01 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.64 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  26.98 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  23.56 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  22.12 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  22.05 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  28.37 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  27.86 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  26.81 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  27.48 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.35 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.06 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  27.14 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  37.93 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  29.87 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  28.68 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  29.11 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  26.57 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  30.26 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  25.36 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  25.18 
 
 		 354 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  26.98 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>