97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2925 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 440 aa  914    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  58.05 
 
 		 441 aa  564  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  46.23 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  41.82 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  41.01 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  44.59 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.11 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  30.41 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  27.05 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 		 331 aa  54.3  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  23.32 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  27.91 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  32.48 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.7 
 
 		 341 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.76 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.86 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  24.07 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01990  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.412201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.41 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.18 
 
 		 299 aa  47.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2826  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.41 
 
 		 169 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 281 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2512  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.41 
 
 		 169 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.19 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.3 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.74 
 
 		 235 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04770  ribonucleoside-triphosphate reductase class III activase subunit  28.16 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0269333  normal  0.584897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  23.78 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.74 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 330 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.13 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.58 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.97 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  29.81 
 
 		 649 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.56 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 		 369 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  28.23 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.95 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 337 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 337 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.09 
 
 		 368 aa  43.9  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  22.34 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.41 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.78 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.15 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  24.09 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.58 
 
 		 238 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.93 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  20.86 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.44 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.03 
 
 		 348 aa  43.1  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  28.46 
 
 		 305 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.98 
 
 		 310 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.12 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>