More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2914 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  100 
 
 
354 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  81.92 
 
 
352 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  77.97 
 
 
354 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  78.53 
 
 
354 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  77.97 
 
 
354 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  77.97 
 
 
354 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  77.97 
 
 
354 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  77.4 
 
 
354 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  77.4 
 
 
354 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  76.55 
 
 
354 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  77.68 
 
 
354 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  77.68 
 
 
354 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  53.19 
 
 
333 aa  363  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  49.28 
 
 
415 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  51.85 
 
 
350 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  46.45 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.48 
 
 
362 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.43 
 
 
356 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  39.72 
 
 
344 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  37.63 
 
 
335 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  39.21 
 
 
317 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
317 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
317 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  39.71 
 
 
335 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  37.86 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  37.5 
 
 
335 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
335 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  38.57 
 
 
335 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  34.56 
 
 
323 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  33.33 
 
 
332 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  35.92 
 
 
344 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  32.92 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  36.43 
 
 
346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  31.9 
 
 
322 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  36.75 
 
 
345 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  34.35 
 
 
319 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  31.86 
 
 
336 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.61 
 
 
331 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  31.94 
 
 
316 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
312 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
312 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  32.62 
 
 
316 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  31.9 
 
 
316 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  30.99 
 
 
314 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  30.03 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  32 
 
 
316 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  32.26 
 
 
314 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  33.1 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  29.41 
 
 
369 aa  133  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  31.93 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  30.39 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  31.93 
 
 
316 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
316 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  30.31 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  31.23 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  25.44 
 
 
317 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  32.03 
 
 
316 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  29.66 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  29.66 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  32.43 
 
 
326 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  26.04 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  25.76 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  27.08 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.27 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  26.76 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  28.34 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  26.76 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  28.03 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  24.67 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  25.5 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.77 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.77 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.77 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.77 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.77 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  26.33 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  24.65 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  27.47 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  28.05 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  27.73 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  26.5 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  25.09 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  22.68 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  28.89 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  26.74 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  24.91 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  26.03 
 
 
348 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  25.09 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  25.44 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  25 
 
 
334 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  26.35 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  24.56 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  24.56 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  24.56 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>