63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2876 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
465 aa  963  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  29.85 
 
 
647 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  36.71 
 
 
632 aa  180  6e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  24.81 
 
 
750 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  25.07 
 
 
629 aa  115  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  25.07 
 
 
629 aa  115  2e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.85 
 
 
632 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.12 
 
 
619 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  25.82 
 
 
462 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  24.23 
 
 
617 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  27.04 
 
 
519 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.26 
 
 
858 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.33 
 
 
640 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.92 
 
 
589 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  24.73 
 
 
728 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.13 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  26.94 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25.08 
 
 
562 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.84 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  26.63 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  26.79 
 
 
322 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  25.99 
 
 
596 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  25.43 
 
 
614 aa  84.7  3e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  25.41 
 
 
467 aa  84  5e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  23.03 
 
 
719 aa  83.6  7e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  25.32 
 
 
404 aa  82.8  1e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  22.56 
 
 
585 aa  79.3  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  22.56 
 
 
585 aa  79.3  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  22.56 
 
 
585 aa  79.3  1e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  26.51 
 
 
754 aa  79.3  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  22.64 
 
 
747 aa  77.4  5e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.77 
 
 
403 aa  77.4  5e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  21.83 
 
 
465 aa  75.1  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  24.41 
 
 
598 aa  73.9  6e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  30.94 
 
 
509 aa  73.6  7e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 
671 aa  73.6  7e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  22.04 
 
 
660 aa  73.2  9e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  30.83 
 
 
302 aa  72.4  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  24.88 
 
 
361 aa  68.2  3e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  22.52 
 
 
581 aa  67  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  21.88 
 
 
631 aa  65.9  2e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  24.04 
 
 
651 aa  65.1  2e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  26.2 
 
 
557 aa  65.9  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  26.85 
 
 
477 aa  65.1  2e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  21.82 
 
 
585 aa  64.7  3e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  28.37 
 
 
423 aa  63.9  6e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  24.38 
 
 
413 aa  63.5  8e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  22.78 
 
 
585 aa  63.5  8e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  24.69 
 
 
590 aa  63.5  8e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  26.49 
 
 
299 aa  62  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  21.4 
 
 
541 aa  61.2  4e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  21.86 
 
 
649 aa  59.3  1e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.45 
 
 
750 aa  58.9  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  30.3 
 
 
664 aa  57.4  5e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  21.71 
 
 
585 aa  55.5  2e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  22.39 
 
 
482 aa  52  2e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  22.19 
 
 
467 aa  52  2e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  26.8 
 
 
1122 aa  50.8  5e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  22.22 
 
 
647 aa  50.8  6e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  30.48 
 
 
380 aa  50.1  9e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  38.98 
 
 
556 aa  50.1  9e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  28 
 
 
405 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  29.73 
 
 
700 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>