143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2828 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  100 
 
 
341 aa  674  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  56.04 
 
 
329 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  51.33 
 
 
325 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  58.24 
 
 
270 aa  306  4e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  47.18 
 
 
329 aa  283  2e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  44.67 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  44.44 
 
 
324 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  47.1 
 
 
322 aa  279  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  45.02 
 
 
317 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  47 
 
 
337 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  46.15 
 
 
317 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  51.2 
 
 
319 aa  275  1e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  43.15 
 
 
317 aa  271  8e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  45.73 
 
 
316 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.51 
 
 
584 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  49.66 
 
 
336 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.1 
 
 
321 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  46.29 
 
 
335 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  44.29 
 
 
321 aa  265  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  44.98 
 
 
322 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  45.42 
 
 
321 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  45.54 
 
 
337 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  45.36 
 
 
324 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  43.12 
 
 
343 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  43.77 
 
 
323 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  45.99 
 
 
325 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  40 
 
 
338 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  42.66 
 
 
321 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  44.67 
 
 
325 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  45.36 
 
 
323 aa  254  2e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  41.32 
 
 
341 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  44.15 
 
 
320 aa  252  5e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.49 
 
 
327 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  43.75 
 
 
341 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  44.72 
 
 
322 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  45.07 
 
 
322 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  43.64 
 
 
344 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  44.03 
 
 
319 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  44.71 
 
 
323 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  245  7e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  43.24 
 
 
320 aa  245  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  45.07 
 
 
326 aa  244  1e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  45.07 
 
 
326 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  45.08 
 
 
323 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  43.69 
 
 
322 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  46.08 
 
 
330 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.42 
 
 
323 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.42 
 
 
323 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.42 
 
 
323 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.42 
 
 
323 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.09 
 
 
323 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  43.69 
 
 
329 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  43.38 
 
 
323 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  43.09 
 
 
323 aa  236  5e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  43.09 
 
 
323 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  41.07 
 
 
331 aa  234  1e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  43.34 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  43.34 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  43.34 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  43.69 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  43.66 
 
 
321 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  39.76 
 
 
328 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  35.61 
 
 
329 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  35.79 
 
 
331 aa  214  1e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  38.87 
 
 
349 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  40.4 
 
 
370 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  40.67 
 
 
332 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  39.12 
 
 
349 aa  208  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  35.78 
 
 
340 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  37.37 
 
 
333 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.62 
 
 
334 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  40 
 
 
332 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  36.2 
 
 
359 aa  203  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  36.11 
 
 
328 aa  203  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  35.2 
 
 
327 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  36.7 
 
 
334 aa  198  1e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  36.61 
 
 
329 aa  197  2e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.82 
 
 
347 aa  195  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  39.18 
 
 
320 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  38.81 
 
 
298 aa  189  5e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  36.43 
 
 
313 aa  182  5e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  35.45 
 
 
322 aa  175  1e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  32.24 
 
 
331 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  32.18 
 
 
344 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.37 
 
 
344 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  30.09 
 
 
640 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.38 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  31.03 
 
 
355 aa  140  4e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  30.29 
 
 
384 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  30.25 
 
 
320 aa  135  1e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  26.94 
 
 
324 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  30.8 
 
 
320 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  30.07 
 
 
322 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  30.66 
 
 
327 aa  120  4e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  29.72 
 
 
324 aa  118  1e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  27.46 
 
 
329 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.33 
 
 
327 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  25.81 
 
 
315 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  29.33 
 
 
329 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  26.64 
 
 
326 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>