283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2788 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
570 aa  1184    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  48.67 
 
 
525 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.07 
 
 
536 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  49.89 
 
 
522 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.28 
 
 
525 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.75 
 
 
530 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  50.57 
 
 
524 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.36 
 
 
543 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.86 
 
 
540 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.73 
 
 
541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  44.52 
 
 
544 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 
536 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  41.91 
 
 
536 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  44.86 
 
 
547 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  42.98 
 
 
535 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 
470 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
536 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  43.36 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  41.82 
 
 
535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  42.04 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.52 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.58 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  43.01 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  42.13 
 
 
467 aa  392  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.87 
 
 
462 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.59 
 
 
474 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  46.67 
 
 
540 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  43.89 
 
 
476 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.39 
 
 
467 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 
463 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.87 
 
 
462 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  41.9 
 
 
467 aa  389  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  41.74 
 
 
462 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  40.56 
 
 
467 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  40.77 
 
 
467 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  43.27 
 
 
464 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.78 
 
 
466 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  44.3 
 
 
533 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.55 
 
 
532 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  46 
 
 
542 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  42.49 
 
 
468 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 
465 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  43.42 
 
 
547 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.24 
 
 
480 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  42.21 
 
 
478 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.77 
 
 
470 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  40.18 
 
 
476 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.16 
 
 
469 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.06 
 
 
465 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.24 
 
 
480 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 
478 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.02 
 
 
480 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 
464 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.32 
 
 
490 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  41.27 
 
 
480 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.27 
 
 
480 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 
465 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  42.02 
 
 
460 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 
464 aa  365  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
464 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.59 
 
 
480 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
531 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
466 aa  362  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.12 
 
 
455 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  41.57 
 
 
461 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.57 
 
 
490 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  39.83 
 
 
464 aa  360  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 
465 aa  359  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  41.59 
 
 
470 aa  359  8e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  39.74 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  41.8 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.13 
 
 
464 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  39.78 
 
 
478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 
489 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.8 
 
 
460 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  39.79 
 
 
515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  42.51 
 
 
532 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 
462 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  42.35 
 
 
469 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  38.67 
 
 
484 aa  350  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  43.68 
 
 
535 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40 
 
 
481 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 
467 aa  346  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.91 
 
 
471 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 
454 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 
454 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  40.13 
 
 
451 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 
453 aa  340  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 
455 aa  340  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  39.61 
 
 
455 aa  339  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  38.88 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 
467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  38.44 
 
 
452 aa  334  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  39.56 
 
 
453 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  38.51 
 
 
452 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  39.33 
 
 
470 aa  332  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
455 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  38.29 
 
 
452 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  38.01 
 
 
452 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>