More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2719 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  67.65 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  65.02 
 
 
269 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  65.02 
 
 
269 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  65.02 
 
 
223 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  66.5 
 
 
204 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  65.02 
 
 
223 aa  260  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  65.02 
 
 
223 aa  260  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  65.02 
 
 
206 aa  260  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  65.02 
 
 
206 aa  260  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  65.02 
 
 
206 aa  260  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  65.02 
 
 
206 aa  260  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  65.02 
 
 
207 aa  258  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  64.53 
 
 
206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  64.04 
 
 
206 aa  256  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  62.69 
 
 
222 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  63.73 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  63.73 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  64.14 
 
 
202 aa  250  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.65 
 
 
215 aa  248  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.13 
 
 
207 aa  245  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  57.43 
 
 
204 aa  242  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  56.4 
 
 
213 aa  241  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.5 
 
 
206 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  56.35 
 
 
203 aa  232  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  55.84 
 
 
203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.08 
 
 
222 aa  227  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  55.5 
 
 
204 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  54.95 
 
 
205 aa  224  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  56.35 
 
 
204 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.18 
 
 
214 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.46 
 
 
233 aa  217  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.42 
 
 
212 aa  214  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  50.95 
 
 
232 aa  214  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  50.48 
 
 
230 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  52.53 
 
 
208 aa  214  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  50.48 
 
 
230 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  50.48 
 
 
230 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.76 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  52 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  55.56 
 
 
207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  49.76 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.72 
 
 
212 aa  211  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  50 
 
 
232 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  49.53 
 
 
238 aa  208  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  48.29 
 
 
261 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  46.12 
 
 
250 aa  207  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  48.29 
 
 
258 aa  206  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.11 
 
 
235 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  45.93 
 
 
236 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  47.39 
 
 
263 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  45.13 
 
 
256 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.62 
 
 
243 aa  203  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  46.82 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.78 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  47.47 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.92 
 
 
229 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.09 
 
 
228 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.54 
 
 
252 aa  198  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  45.81 
 
 
275 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.78 
 
 
219 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  46.48 
 
 
236 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.98 
 
 
196 aa  194  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.92 
 
 
234 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  44.34 
 
 
252 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 
212 aa  192  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.34 
 
 
244 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  45.71 
 
 
252 aa  191  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  45.93 
 
 
239 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.1 
 
 
258 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.5 
 
 
227 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.49 
 
 
241 aa  188  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  50.25 
 
 
212 aa  188  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  43.81 
 
 
288 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  42.36 
 
 
249 aa  181  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.89 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.61 
 
 
231 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  42.22 
 
 
241 aa  175  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.18 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  44 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.41 
 
 
228 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  42.04 
 
 
230 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  44.88 
 
 
201 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.78 
 
 
229 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  45.27 
 
 
201 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.72 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.56 
 
 
200 aa  165  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.78 
 
 
201 aa  164  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.83 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  43.18 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  44.28 
 
 
203 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.14 
 
 
201 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.07 
 
 
207 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  43.28 
 
 
226 aa  158  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  42.44 
 
 
209 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  42.93 
 
 
210 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.84 
 
 
197 aa  154  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  43.35 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  42.72 
 
 
214 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.8 
 
 
207 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>