More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2683 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.02 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  49.18 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 450 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.68 
 
 		 372 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  50 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.25 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.19 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  47.45 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 454 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  52.03 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  50 
 
 		 298 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  41.33 
 
 		 285 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  50 
 
 		 150 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 424 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  58.43 
 
 		 286 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  49.54 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.26 
 
 		 370 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  50.42 
 
 		 341 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.22 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.79 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  41.22 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 476 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  56.47 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  40.99 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  41.83 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  47.2 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.83 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.49 
 
 		 318 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.48 
 
 		 181 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  43.88 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  42.61 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  47.46 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  40.27 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  47.2 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.91 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  43.61 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  44.6 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 335 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  43.61 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  41.56 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  45.13 
 
 		 1048 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  42.98 
 
 		 342 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  37.24 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 407 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  37.93 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  39.01 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.23 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 404 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 404 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  50.52 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  37.24 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  39.52 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  37.24 
 
 		 269 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 333 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  39.52 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  40.46 
 
 		 333 aa  101  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  34.76 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>