More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2651 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  100 
 
 
449 aa  889    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  65.54 
 
 
454 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  60.14 
 
 
455 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  57.67 
 
 
454 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  44.77 
 
 
455 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  44.77 
 
 
455 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  43.27 
 
 
455 aa  352  8e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  40.5 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  38.7 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  39.68 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  41.19 
 
 
456 aa  311  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  39.16 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  37.81 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  37.93 
 
 
442 aa  306  7e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  40.39 
 
 
496 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  37.22 
 
 
466 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  39.46 
 
 
460 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  38.58 
 
 
493 aa  292  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  40.13 
 
 
464 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  32.1 
 
 
466 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  37.16 
 
 
460 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  37.83 
 
 
461 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  36.52 
 
 
449 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  33.79 
 
 
447 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  36.28 
 
 
448 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  36.99 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  35.08 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  36.51 
 
 
455 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  34.44 
 
 
455 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  37.14 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  34.99 
 
 
447 aa  247  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  32.87 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  32.27 
 
 
451 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  34.75 
 
 
451 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  35.45 
 
 
454 aa  236  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.47 
 
 
451 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  32.43 
 
 
448 aa  234  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  35.51 
 
 
451 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.8 
 
 
451 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.33 
 
 
472 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.02 
 
 
451 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.8 
 
 
451 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  34.76 
 
 
451 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.8 
 
 
451 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.09 
 
 
452 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
451 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.57 
 
 
451 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
451 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
452 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.34 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  33.94 
 
 
470 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  30.55 
 
 
450 aa  226  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  32.81 
 
 
462 aa  223  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.41 
 
 
452 aa  216  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.6 
 
 
496 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.43 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.14 
 
 
447 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  31.07 
 
 
467 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.67 
 
 
448 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  28.76 
 
 
465 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.9 
 
 
446 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  29.56 
 
 
448 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.65 
 
 
442 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  30.58 
 
 
440 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 
472 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.18 
 
 
459 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
456 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.36 
 
 
443 aa  193  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  29.74 
 
 
440 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  28.09 
 
 
458 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.5 
 
 
450 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.5 
 
 
450 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.64 
 
 
450 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.8 
 
 
449 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
448 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  28.81 
 
 
464 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  31.35 
 
 
464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  30.59 
 
 
459 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.94 
 
 
448 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 
451 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 
451 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.64 
 
 
449 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.32 
 
 
451 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.02 
 
 
467 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  28.81 
 
 
444 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.32 
 
 
451 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
459 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  29.53 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  30.51 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
451 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  29.31 
 
 
455 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
460 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.03 
 
 
452 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
472 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.96 
 
 
434 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
461 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>