More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2578 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
124 aa  250  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2287  CBS domain containing protein  34.43 
 
 
123 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.26 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.62 
 
 
688 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
688 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  32.2 
 
 
488 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
313 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  36.28 
 
 
513 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  37.25 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.69 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 
252 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  31.01 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  29.84 
 
 
502 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  37.37 
 
 
513 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.51 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  28.32 
 
 
492 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.43 
 
 
191 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.71 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  27.08 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  32.74 
 
 
513 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  30.16 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.67 
 
 
490 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.17 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  30.95 
 
 
261 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  32.59 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.69 
 
 
291 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  36.36 
 
 
513 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  29.84 
 
 
502 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32.33 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  31.68 
 
 
332 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  23.61 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  27.59 
 
 
161 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.77 
 
 
769 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 
279 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 
272 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  28.93 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.43 
 
 
202 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  28.35 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  33.67 
 
 
282 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
283 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 
236 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
279 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  31.62 
 
 
142 aa  59.3  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  29.03 
 
 
502 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  30 
 
 
216 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.35 
 
 
313 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  32.35 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 
639 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.64 
 
 
279 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  27.97 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.47 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  24.79 
 
 
696 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  29.23 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.63 
 
 
496 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.09 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  30.08 
 
 
295 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.79 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  29.46 
 
 
496 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  23.62 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2035  hypothetical protein  28.81 
 
 
148 aa  58.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  30.65 
 
 
377 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  27.73 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.86 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  29.77 
 
 
208 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
605 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
258 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
232 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  28.23 
 
 
315 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  29.06 
 
 
503 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  25.33 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  24.79 
 
 
279 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  29.13 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 
279 aa  57  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  27.68 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  32.2 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  31.13 
 
 
331 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  31.36 
 
 
189 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  31.36 
 
 
189 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>