More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2570 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  39.37 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  30.09 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  28.89 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  35 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  35 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  35 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  35 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  35 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  28.45 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  30.58 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.9 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.7 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  30.64 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 376 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>