133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2461 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  73.72 
 
 		 156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  73.89 
 
 		 157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  73.72 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 156 aa  235  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  72 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.11 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  30.12 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 113 aa  48.5  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  21.09 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  19.84 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>