More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2357 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  47.6 
 
 
233 aa  234  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  47.23 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  47.23 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  44.98 
 
 
246 aa  211  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  52.66 
 
 
230 aa  208  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  49.74 
 
 
269 aa  204  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  42.79 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  44.62 
 
 
313 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  44 
 
 
239 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  45.26 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  44.75 
 
 
223 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  42.7 
 
 
204 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  40.19 
 
 
250 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  43.16 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  38.81 
 
 
256 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  40.64 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.18 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.18 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  46.36 
 
 
271 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  43.32 
 
 
290 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  40.84 
 
 
224 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  40.64 
 
 
216 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.64 
 
 
216 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  40.1 
 
 
261 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  39.57 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  44.44 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  43.92 
 
 
249 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  39.22 
 
 
203 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  35.83 
 
 
212 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  35.26 
 
 
263 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  35.26 
 
 
263 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  33.69 
 
 
217 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  34.76 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  35.16 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  34.76 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  32.98 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  34.38 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  37.75 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  37.75 
 
 
212 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  37.75 
 
 
212 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  35.27 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  32.63 
 
 
267 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  34.59 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  35.26 
 
 
211 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  35.26 
 
 
211 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  36.54 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  36.2 
 
 
226 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  34.69 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  37.69 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  32.32 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.33 
 
 
722 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  31.87 
 
 
705 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.87 
 
 
705 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.25 
 
 
705 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  38.1 
 
 
714 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  32.06 
 
 
362 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3196  RelA/SpoT family protein  32.73 
 
 
743 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0189864  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.73 
 
 
743 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1575  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.06 
 
 
743 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145975  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  26.26 
 
 
296 aa  55.5  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.19 
 
 
705 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40 
 
 
717 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0431  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.17 
 
 
715 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  29.82 
 
 
356 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  28.74 
 
 
359 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  33 
 
 
366 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  28.95 
 
 
356 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.83 
 
 
751 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  36.19 
 
 
710 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
736 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1728  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.57 
 
 
705 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2721  GTP diphosphokinase  31.54 
 
 
763 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157165  normal  0.673281 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.19 
 
 
726 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0033  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30 
 
 
732 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.96 
 
 
753 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3435  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  34.95 
 
 
701 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.821771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0363  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  27.91 
 
 
702 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0787  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40 
 
 
722 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.239727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03507  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.16 
 
 
702 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03459  hypothetical protein  28.16 
 
 
702 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0050  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.82 
 
 
715 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0055  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.16 
 
 
702 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3985  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.16 
 
 
702 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3861  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.16 
 
 
702 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5022  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.16 
 
 
702 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0061  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.16 
 
 
702 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4153  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.16 
 
 
702 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>