154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2331 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 406 aa  840    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  48.38 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  47.25 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  33.75 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  27.43 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.1 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  28.93 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 553 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  24.92 
 
 		 538 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 537 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  24.82 
 
 		 618 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.8 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.5 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  23.29 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.01 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  24.03 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  24.51 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.95 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  23.15 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.54 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  32.93 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.32 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  31.78 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.08 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  29.2 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.88 
 
 		 609 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.93 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.43 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  24.06 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  27.19 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  21.41 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  22.47 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  22.02 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  22.96 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  27.74 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  23.81 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  26.55 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  23.41 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  25.36 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  25.36 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  25.36 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  25.36 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  25.93 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  18.69 
 
 		 552 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  23.88 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  22.94 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.05 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  36.25 
 
 		 519 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  27.34 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  22.4 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  24.55 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 524 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.22 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  25.14 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.74 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  21.75 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.2 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  31.48 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  24.05 
 
 		 520 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  22.93 
 
 		 627 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  24.21 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  24.85 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  33.61 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.34 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  20.66 
 
 		 645 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.25 
 
 		 480 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  24.36 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  31.76 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  29.25 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  23.05 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  21.32 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  23.74 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  40 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  32.77 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 597 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  28.97 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  29.2 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 659 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  35.78 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  29.37 
 
 		 705 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  32.77 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  29.1 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  23.96 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.25 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.27 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 		 547 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>