38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2318 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  738    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  44.96 
 
 
355 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  41.48 
 
 
354 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  40.86 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  42.69 
 
 
350 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  44.16 
 
 
361 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  35.18 
 
 
356 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  34.76 
 
 
356 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  32.66 
 
 
342 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  32.09 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  31.94 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  28.61 
 
 
344 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  28.29 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  26.84 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  27.32 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  24.79 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  26.84 
 
 
346 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  25.14 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  28.17 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.24 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  23.4 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.48 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.48 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.86 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.4 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.15 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  28.07 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.42 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.5 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  22.91 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  39.34 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.07 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.32 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  22.7 
 
 
342 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.4 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.8 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.63 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>