20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2307 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1280    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  42.88 
 
 
654 aa  411  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  40.68 
 
 
617 aa  356  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  39.64 
 
 
616 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  38.8 
 
 
594 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  33.46 
 
 
644 aa  290  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  33.39 
 
 
628 aa  250  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  31.12 
 
 
598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  32.13 
 
 
579 aa  208  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  31.15 
 
 
676 aa  192  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  35.63 
 
 
460 aa  187  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  33.5 
 
 
742 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  32.27 
 
 
504 aa  170  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  32.69 
 
 
534 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.33 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  38.92 
 
 
286 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  32.8 
 
 
762 aa  94.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  40.31 
 
 
592 aa  88.2  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  37.24 
 
 
371 aa  87  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.43 
 
 
2884 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>