More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2298 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  87.7 
 
 
246 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  71.6 
 
 
245 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  70 
 
 
246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  65.43 
 
 
246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.42 
 
 
248 aa  334  9e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  64.56 
 
 
254 aa  333  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0135  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.88 
 
 
246 aa  332  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0181638  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  65 
 
 
243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0213  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.05 
 
 
246 aa  325  5e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  61.83 
 
 
265 aa  321  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  62.24 
 
 
246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  62.66 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  59.92 
 
 
257 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.16 
 
 
251 aa  308  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  58.54 
 
 
260 aa  305  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  59.34 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 
273 aa  301  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  60.33 
 
 
255 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  60.66 
 
 
269 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  57.98 
 
 
363 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  57.98 
 
 
363 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  59.43 
 
 
262 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60 
 
 
244 aa  300  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
240 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.25 
 
 
240 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.75 
 
 
267 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.25 
 
 
244 aa  294  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 
244 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.58 
 
 
247 aa  292  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.74 
 
 
249 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
244 aa  291  7e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  56.72 
 
 
363 aa  289  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.68 
 
 
240 aa  288  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  288  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  57.14 
 
 
360 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  56.72 
 
 
363 aa  288  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.97 
 
 
244 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  58.33 
 
 
242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  58.33 
 
 
242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.08 
 
 
246 aa  285  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  57.2 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  61 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  59.17 
 
 
252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.5 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  57.14 
 
 
286 aa  282  3.0000000000000004e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  60.58 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  56.73 
 
 
247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.92 
 
 
243 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.97 
 
 
243 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.92 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  57.32 
 
 
246 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
241 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 
246 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
242 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  57.32 
 
 
246 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.51 
 
 
243 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  279  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.44 
 
 
244 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
240 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.25 
 
 
240 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.25 
 
 
242 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.92 
 
 
244 aa  278  7e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  54.58 
 
 
247 aa  278  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  277  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  276  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  57.26 
 
 
253 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.26 
 
 
244 aa  277  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.73 
 
 
243 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 
241 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
242 aa  276  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.61 
 
 
255 aa  275  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
242 aa  275  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.07 
 
 
246 aa  275  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.02 
 
 
242 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 
240 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.2 
 
 
243 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  274  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.85 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.25 
 
 
241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  57.2 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.25 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>