More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2228 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  45.65 
 
 
351 aa  216  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  42.06 
 
 
345 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  42.74 
 
 
353 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  42.06 
 
 
348 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 
353 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  43.59 
 
 
312 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
355 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  43.35 
 
 
347 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3264  Sigma 54 interacting domain protein  47 
 
 
231 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  44.59 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  42.74 
 
 
353 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 
353 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  43.16 
 
 
353 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
353 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  40.34 
 
 
357 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  42.49 
 
 
335 aa  192  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
330 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
330 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 
349 aa  191  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0766  ABC transporter related  44.59 
 
 
312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.812823  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  40.17 
 
 
363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
376 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  43.4 
 
 
361 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  41.53 
 
 
323 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  40.6 
 
 
314 aa  186  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
376 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
376 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
376 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
376 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  35.9 
 
 
386 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40.55 
 
 
373 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
330 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
330 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.57 
 
 
358 aa  185  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.64 
 
 
340 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 
357 aa  185  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.07 
 
 
344 aa  185  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4601  ABC transporter related  39.24 
 
 
382 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.531787  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 
376 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.09 
 
 
339 aa  184  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  37.6 
 
 
346 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  37.6 
 
 
346 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  37.6 
 
 
346 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  42.08 
 
 
376 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  39.08 
 
 
350 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  40.95 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  40.99 
 
 
369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  39.04 
 
 
391 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  40.99 
 
 
369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 
372 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  40.99 
 
 
369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
377 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  40.99 
 
 
369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  37.83 
 
 
351 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
342 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
374 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  40.99 
 
 
369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.28 
 
 
374 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
376 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
330 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
376 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  41.01 
 
 
339 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
374 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
374 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  41.78 
 
 
371 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  39.41 
 
 
383 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  37.83 
 
 
343 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.83 
 
 
343 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.25 
 
 
376 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
371 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.83 
 
 
343 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 
363 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  40.68 
 
 
329 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  41.12 
 
 
356 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 
388 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
388 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
388 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
332 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  40.68 
 
 
329 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
377 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  40.43 
 
 
381 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 
384 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
377 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
377 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 
343 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.35 
 
 
369 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5131  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.93 
 
 
381 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.55 
 
 
373 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 
376 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3449  ABC transporter related  38.72 
 
 
363 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.79 
 
 
355 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
355 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.66 
 
 
372 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 
376 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
377 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.22 
 
 
376 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>