More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2220 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  69.58 
 
 
885 aa  1315    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.08 
 
 
642 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  100 
 
 
882 aa  1828    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  68.64 
 
 
888 aa  1307    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  45.53 
 
 
751 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  50.39 
 
 
640 aa  662    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  71.12 
 
 
880 aa  1327    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  45.58 
 
 
646 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  45.58 
 
 
646 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  32.23 
 
 
647 aa  294  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  31.36 
 
 
647 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  31.3 
 
 
647 aa  288  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  31 
 
 
647 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  31.21 
 
 
647 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  31.07 
 
 
647 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  31.77 
 
 
647 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  30.99 
 
 
647 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  30.99 
 
 
647 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  31.37 
 
 
647 aa  284  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  29.12 
 
 
691 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  32.24 
 
 
656 aa  275  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  28.59 
 
 
673 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  28.45 
 
 
694 aa  268  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  28.73 
 
 
639 aa  267  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  29.41 
 
 
691 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  28.81 
 
 
691 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.07 
 
 
692 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  28.32 
 
 
689 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  27.53 
 
 
691 aa  266  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  28.29 
 
 
691 aa  265  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  28.2 
 
 
697 aa  265  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  28.87 
 
 
699 aa  265  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  27.97 
 
 
691 aa  265  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  29.26 
 
 
691 aa  265  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  28.33 
 
 
699 aa  264  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  28.33 
 
 
699 aa  264  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.95 
 
 
691 aa  264  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  28.44 
 
 
688 aa  263  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  28.09 
 
 
700 aa  263  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  28.81 
 
 
691 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  28.48 
 
 
694 aa  262  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  28.38 
 
 
692 aa  262  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  28.26 
 
 
691 aa  262  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  28.33 
 
 
694 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  28.31 
 
 
689 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  28.55 
 
 
691 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  27.92 
 
 
695 aa  261  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.81 
 
 
692 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  29.32 
 
 
692 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0861  elongation factor G  27.87 
 
 
698 aa  260  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  29.09 
 
 
692 aa  260  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  28.33 
 
 
701 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.27 
 
 
691 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  29.17 
 
 
691 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  27.6 
 
 
702 aa  259  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.51 
 
 
691 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  28.65 
 
 
700 aa  259  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  29.61 
 
 
678 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  29.32 
 
 
701 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  28.3 
 
 
691 aa  257  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  28.12 
 
 
691 aa  258  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  28.72 
 
 
708 aa  257  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  28.51 
 
 
697 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  27.78 
 
 
691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  28.01 
 
 
691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4918  translation elongation factor G  28.86 
 
 
699 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  28.19 
 
 
692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  28.82 
 
 
700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  28.13 
 
 
701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  27.71 
 
 
691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  28.01 
 
 
691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.13 
 
 
691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  28.1 
 
 
697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  28.65 
 
 
698 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  29.15 
 
 
700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  28.47 
 
 
698 aa  256  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  27.86 
 
 
691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  28.44 
 
 
698 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  255  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.14 
 
 
715 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  28.02 
 
 
700 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  28.28 
 
 
701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  27.45 
 
 
692 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  27.27 
 
 
691 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  28.57 
 
 
708 aa  254  5.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  28.09 
 
 
692 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  27.89 
 
 
700 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  27.89 
 
 
700 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  27.92 
 
 
693 aa  254  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  28.12 
 
 
692 aa  254  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  27.3 
 
 
692 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  28.27 
 
 
709 aa  253  9.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  27.3 
 
 
692 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0961  elongation factor G  27.8 
 
 
690 aa  253  9.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>