More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2193 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.03 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  51.33 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2250  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  50.45 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  50.9 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.55 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5586  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  43.78 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  45.85 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  43.48 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  45.95 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  45.58 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  45.09 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 242 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.88 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.3 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  47.37 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 232 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  46.88 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.16 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  42.79 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  41.45 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>