155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2188 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
343 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  88.05 
 
 
343 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  77.84 
 
 
343 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.48 
 
 
343 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  57.73 
 
 
343 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  56.27 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.07 
 
 
343 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  51.6 
 
 
343 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  50.73 
 
 
343 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.73 
 
 
343 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.91 
 
 
344 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  49.85 
 
 
343 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.48 
 
 
343 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.6 
 
 
344 aa  361  9e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  52.77 
 
 
343 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  51.87 
 
 
346 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  49.71 
 
 
346 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  54.76 
 
 
344 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  50.87 
 
 
344 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.06 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  44.57 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.02 
 
 
341 aa  302  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.02 
 
 
344 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.02 
 
 
343 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  43.99 
 
 
339 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.31 
 
 
343 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  43.02 
 
 
344 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  43.44 
 
 
344 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.57 
 
 
342 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  41.06 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.61 
 
 
342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 
598 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.18 
 
 
344 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  34.71 
 
 
333 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.83 
 
 
545 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.74 
 
 
559 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 
339 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.42 
 
 
570 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.03 
 
 
550 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.38 
 
 
339 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.55 
 
 
553 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.53 
 
 
326 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.43 
 
 
339 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  32.63 
 
 
325 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  34.72 
 
 
594 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  32.34 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.66 
 
 
544 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 
331 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.44 
 
 
580 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.95 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 
525 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.52 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.14 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  29.91 
 
 
325 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.7 
 
 
334 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.88 
 
 
347 aa  156  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.37 
 
 
731 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.79 
 
 
333 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.07 
 
 
731 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 
334 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.54 
 
 
336 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.35 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  30.5 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  29.58 
 
 
727 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.14 
 
 
350 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  28.28 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.29 
 
 
558 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  30.61 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  30.72 
 
 
371 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.21 
 
 
331 aa  122  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.41 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.6 
 
 
330 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.15 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.52 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.8 
 
 
338 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.38 
 
 
337 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.49 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  25.35 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  28.1 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.26 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.46 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  23.44 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.57 
 
 
337 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  26.71 
 
 
323 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 
329 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  24.36 
 
 
330 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  23.45 
 
 
333 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.58 
 
 
327 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
398 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.5 
 
 
333 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.27 
 
 
326 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.84 
 
 
333 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 
330 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  23.96 
 
 
330 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.33 
 
 
402 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  23.75 
 
 
331 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.38 
 
 
330 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.81 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  36.65 
 
 
207 aa  99.4  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>