More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2120 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 111 aa  230  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  51.55 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  52.94 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.55 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  46.88 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44.23 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  43.75 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  43 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  47.37 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  37.63 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  37.63 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  40.43 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 120 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>