258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2118 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
205 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  48.76 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  48.76 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  48.76 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  48.76 
 
 
211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  48.76 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  48.76 
 
 
205 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  48.22 
 
 
205 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  47.26 
 
 
205 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  36.6 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
219 aa  121  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
205 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  33.51 
 
 
205 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 
193 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  32.16 
 
 
228 aa  105  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  32.99 
 
 
207 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
207 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
179 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
181 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  27.41 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  27.51 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.57 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  28.04 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  27.71 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  45.59 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  25.13 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  30 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  27.65 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  31.69 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  49.23 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  25.27 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  26.44 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  25.91 
 
 
190 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
181 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  23.66 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  37.14 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  28.11 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  23.4 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  43.08 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  23.33 
 
 
181 aa  58.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  23.4 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>