More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2067 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  61.5 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  34.86 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.38 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.03 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.5 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 239 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.59 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.67 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.25 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.7 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.26 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  32.39 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.17 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  28.33 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.79 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  31.17 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  30.04 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.6 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  28.96 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 379 aa  98.6  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 215 aa  98.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  29.26 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  33.8 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  29.11 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 218 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  28.57 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.43 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.13 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.15 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  30.66 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  31.54 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  28.57 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  31.25 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  31.25 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  28.74 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  31.25 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  31.25 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  29.82 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.43 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  32.19 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  27.95 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  33.03 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5598  GntR domain protein  30.41 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  29.8 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  28.34 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  31.49 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  29.8 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  31.2 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.51 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  25.63 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.76 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  30.77 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.73 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.18 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>