More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2016 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 517 aa  1051    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 231 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  35.78 
 
 		 218 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 217 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.19 
 
 		 220 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  37.32 
 
 		 212 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 212 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  35.71 
 
 		 214 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.89 
 
 		 379 aa  134  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  36.15 
 
 		 215 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  36.15 
 
 		 215 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.23 
 
 		 379 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.66 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  34.91 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  35.29 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  35.29 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  34.76 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  34.22 
 
 		 217 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  34.9 
 
 		 215 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  35.98 
 
 		 217 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.1 
 
 		 228 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 287 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 405 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  30.03 
 
 		 390 aa  97.8  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  29.77 
 
 		 405 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  34.22 
 
 		 217 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 462 aa  93.2  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 397 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.13 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25 
 
 		 370 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  29.92 
 
 		 350 aa  90.5  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 390 aa  90.1  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  34.11 
 
 		 509 aa  90.1  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 365 aa  90.1  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 400 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 328 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 386 aa  89  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 331 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  29.76 
 
 		 349 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 432 aa  87.8  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  23.67 
 
 		 383 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  28.75 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  26.21 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  32.81 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.22 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.22 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.22 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  30.47 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.22 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.22 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  27.89 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  32.28 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  27.8 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.57 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  31.85 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  33.57 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  26.03 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  27.8 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.64 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  31.19 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  33.83 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  32.54 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  33.83 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  32.59 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  28.17 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  32.06 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  30.73 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  26.18 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>