More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2014 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.82 
 
 
741 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  100 
 
 
577 aa  1178    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  61.93 
 
 
748 aa  675    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  62 
 
 
741 aa  699    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  58.71 
 
 
755 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  59.28 
 
 
742 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.74 
 
 
765 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  61.55 
 
 
765 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  59.2 
 
 
741 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  58.16 
 
 
755 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  50.52 
 
 
575 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  53.12 
 
 
720 aa  559  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  47.86 
 
 
584 aa  559  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  48.52 
 
 
575 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  47.24 
 
 
574 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  49.04 
 
 
577 aa  541  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  46.07 
 
 
623 aa  544  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  47.8 
 
 
586 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.93 
 
 
719 aa  531  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  45.91 
 
 
582 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  46.79 
 
 
585 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.18 
 
 
579 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  46.23 
 
 
577 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  45.77 
 
 
577 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  44.83 
 
 
577 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  48.17 
 
 
577 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  46.07 
 
 
578 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  44.66 
 
 
577 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  47.08 
 
 
583 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  45.1 
 
 
577 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  44.56 
 
 
577 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
581 aa  495  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
577 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  44.71 
 
 
581 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.24 
 
 
587 aa  492  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  44.39 
 
 
577 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  45.97 
 
 
577 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  46.84 
 
 
577 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.34 
 
 
654 aa  479  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
582 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.31 
 
 
577 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.59 
 
 
577 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  44.76 
 
 
577 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.36 
 
 
578 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  40.94 
 
 
575 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  43.13 
 
 
580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  43.88 
 
 
577 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  41.72 
 
 
573 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
576 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  42.81 
 
 
578 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  41.88 
 
 
577 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.71 
 
 
604 aa  458  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.08 
 
 
578 aa  458  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  41.36 
 
 
577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  40.76 
 
 
583 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.93 
 
 
583 aa  451  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.93 
 
 
579 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  40.95 
 
 
586 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
578 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  39.9 
 
 
593 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
574 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
584 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.79 
 
 
578 aa  437  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.13 
 
 
585 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  41.16 
 
 
595 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  41.16 
 
 
595 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  41.62 
 
 
584 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  41.16 
 
 
595 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
583 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
582 aa  432  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  37.95 
 
 
578 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 
594 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  39.26 
 
 
584 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.26 
 
 
584 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.26 
 
 
584 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.26 
 
 
584 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
581 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.45 
 
 
584 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  36.93 
 
 
577 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  37.11 
 
 
577 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.62 
 
 
584 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  40.66 
 
 
589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.12 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.95 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  37.82 
 
 
578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.74 
 
 
584 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  38.07 
 
 
584 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.37 
 
 
579 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.73 
 
 
652 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  36 
 
 
594 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  35.77 
 
 
578 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 
584 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  36.82 
 
 
582 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_963  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.52 
 
 
290 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0350052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  36.51 
 
 
572 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  38.74 
 
 
575 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  36.22 
 
 
589 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3380  ABC transporter transmembrane region  36.55 
 
 
573 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.4 
 
 
580 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.04 
 
 
572 aa  352  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>