36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2005 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 566 aa  1163    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  26.46 
 
 		 567 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  26.25 
 
 		 580 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  24.66 
 
 		 570 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  40.21 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.32 
 
 		 608 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  24.08 
 
 		 848 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  27.53 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.79 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1143  hypothetical protein  27.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.78 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3318  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.57 
 
 		 611 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3036  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.03 
 
 		 129 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.57121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  36.05 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1088 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3332  hypothetical protein  37.18 
 
 		 129 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  26.05 
 
 		 577 aa  50.8  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  30.66 
 
 		 266 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1468  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.32 
 
 		 157 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0038346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1439  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.32 
 
 		 157 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1088 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0551  hypothetical protein  22.97 
 
 		 701 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00136475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3113  hypothetical protein  35.9 
 
 		 129 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3311  hypothetical protein  38.16 
 
 		 129 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3359  hypothetical protein  35.9 
 
 		 129 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.852787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3100  hypothetical protein  32.05 
 
 		 129 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.122576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1920  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3331  hypothetical protein  27.5 
 
 		 129 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  26.92 
 
 		 1250 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.18 
 
 		 129 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  22.99 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  33.77 
 
 		 144 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  28 
 
 		 273 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>