More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1971 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  35.5 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  34.5 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.76 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  33.45 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  34.11 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  34.55 
 
 		 337 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  33.33 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  32.25 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  33.22 
 
 		 311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  34.39 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  32.86 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  32.25 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  34.42 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  28.86 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  30.79 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  32.9 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  32.18 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  27.46 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  34.27 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  33.67 
 
 		 374 aa  149  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  35.34 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.58 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  36.03 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  31.97 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  35.14 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  32.75 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  32.87 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  31.49 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  35.62 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  35.13 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  32.32 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  33.7 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  28.27 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  34.64 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  29.43 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  32.14 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  30.61 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  30.5 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  28.79 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  31.88 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  32.14 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  30.35 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  30.48 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.13 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  30.1 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  32 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  30.56 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  30.03 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  34.35 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  29.77 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  29.77 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  30.82 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  30.91 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  32.01 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  28.48 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  30.6 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  27.67 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  26.97 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  30.67 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  32.39 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  31.27 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  31.8 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  30.21 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  30.21 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  32.21 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  31.65 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  27.61 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  31.14 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.66 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  31.27 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  28.62 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  29.93 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  29.37 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.22 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  33.46 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  33.46 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  31.97 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31.01 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  30.92 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  33.85 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  32.2 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.08 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  29.39 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  30.12 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  34.36 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  29.8 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>