More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1946 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  48.04 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  48.28 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  46.23 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  43.33 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  45.55 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  45.89 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  46.83 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  43.86 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  44.1 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  40.63 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  45.33 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 339 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  46.53 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.53 
 
 		 336 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  47.08 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  47.08 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  46.09 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.66 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  44.13 
 
 		 640 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  42.71 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  41.34 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  44.25 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.06 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 294 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  36.45 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.82 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  35.57 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.49 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  42.45 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  35.25 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 329 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.1 
 
 		 584 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 365 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  51 
 
 		 120 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.28 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.88 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.16 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.32 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  32.86 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.68 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  31.33 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  24.92 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  29.71 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  29.47 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>