More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1841 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  100 
 
 		 430 aa  880    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  39.06 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  37.91 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  33.11 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  38.66 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  37.93 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  43.3 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  32.88 
 
 		 527 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  29.37 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  29.14 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  35.97 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  34.33 
 
 		 416 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  28.37 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 416 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000404489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  39.3 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 584 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 584 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 504 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0711  Signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.890851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  32.59 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 587 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  38.29 
 
 		 537 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  31.25 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 444 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 459 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  35.11 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  32.48 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 581 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  32.48 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  35.34 
 
 		 511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  36.09 
 
 		 455 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  35.02 
 
 		 508 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 614 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 589 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 597 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 470 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  35.93 
 
 		 449 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 454 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1140  sensor histidine kinase  31.36 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00613378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  34.06 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.28 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1327  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 409 aa  140  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0088456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 597 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 475 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 608 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  34.31 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  31.72 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  31.2 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  33.94 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  30.47 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  40.17 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  34.98 
 
 		 599 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  29.96 
 
 		 336 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 389 aa  137  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  36.49 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 911 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 495 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 582 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  33.03 
 
 		 575 aa  136  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1791  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 571 aa  136  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>