More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1827 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 
213 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  61.06 
 
 
210 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  58.57 
 
 
209 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  58.17 
 
 
210 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  60.21 
 
 
213 aa  225  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  52.38 
 
 
212 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  52.86 
 
 
213 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  50.24 
 
 
212 aa  201  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  50.5 
 
 
209 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  46.19 
 
 
210 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  45.32 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  45.32 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  47.14 
 
 
210 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  47.18 
 
 
210 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  45.31 
 
 
210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.05 
 
 
210 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  42.51 
 
 
607 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  44.08 
 
 
208 aa  157  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.12 
 
 
326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  43.35 
 
 
224 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.34 
 
 
219 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  42.03 
 
 
251 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.39 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.39 
 
 
219 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  39.81 
 
 
214 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  40.98 
 
 
841 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  45.83 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  45.83 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  43.78 
 
 
217 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  39.32 
 
 
804 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  38.22 
 
 
221 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  40.38 
 
 
804 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  41.71 
 
 
259 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  46.34 
 
 
232 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  43.2 
 
 
232 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  44.25 
 
 
235 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  39.71 
 
 
813 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  44.91 
 
 
168 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  43.02 
 
 
232 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  39.71 
 
 
811 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  38.21 
 
 
214 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  39.47 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.96 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  42.26 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  36.7 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.82 
 
 
216 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  39.6 
 
 
804 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  40.22 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  36.45 
 
 
207 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  40.69 
 
 
801 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.96 
 
 
207 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  40.12 
 
 
791 aa  134  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  37.76 
 
 
206 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  41.94 
 
 
556 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  40.91 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  36.89 
 
 
804 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  37.5 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  37.8 
 
 
217 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  36.56 
 
 
220 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  37.2 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  38.61 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  36.32 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  41.42 
 
 
216 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  34.62 
 
 
800 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  38.07 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  40.83 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 
804 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
217 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34 
 
 
839 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  34.95 
 
 
802 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  37.78 
 
 
820 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.77 
 
 
218 aa  121  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  38.04 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  32.77 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  40.38 
 
 
803 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  32.6 
 
 
216 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  37.5 
 
 
218 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33 
 
 
801 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  35.61 
 
 
806 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  36.92 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  36.92 
 
 
818 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  35.54 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  34.3 
 
 
819 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.12 
 
 
1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  33.33 
 
 
804 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.57 
 
 
1132 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  36.13 
 
 
807 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.57 
 
 
1132 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  38.07 
 
 
816 aa  112  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  37.57 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  42.38 
 
 
832 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1133 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1133 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  33.86 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.57 
 
 
1132 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>