75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1718 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  100 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  61.75 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  28.2 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  27.14 
 
 		 269 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  29.02 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  29.26 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  28.62 
 
 		 238 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  40 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  28.63 
 
 		 238 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  29.64 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  30.83 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  28.45 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  26.05 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  27.61 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  29.84 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  30.38 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  28.3 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  39.05 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  27.97 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  37.23 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  39.05 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  39.05 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  39.22 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  28.06 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  38.1 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  39.42 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  38.84 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  41.84 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  26.47 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  37.25 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  27.35 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  40.96 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  29.01 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  30.67 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  33.98 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  26.18 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  25.42 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  34.02 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  29.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42695  ABC(ATP-binding) family transporter  26.55 
 
 		 582 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0547165  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.82 
 
 		 457 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  41.82 
 
 		 532 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  44.23 
 
 		 642 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  27.08 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.17 
 
 		 410 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 767 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  25.89 
 
 		 511 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  23.68 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7259  ABC transporter ATPase  24.3 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  24.26 
 
 		 644 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  26.03 
 
 		 645 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  25.89 
 
 		 511 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1806  ABC transporter related  26.83 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179898  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  26.39 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  29.93 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  25.89 
 
 		 511 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  21.89 
 
 		 569 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  25.89 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  25.89 
 
 		 511 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  23.53 
 
 		 531 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  23.36 
 
 		 1271 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  25.89 
 
 		 511 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  40.38 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  27.6 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  24.24 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  27.69 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  40.82 
 
 		 464 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  24.24 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.25 
 
 		 437 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  25.54 
 
 		 552 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>