186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1621 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
368 aa  761    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  49.86 
 
 
374 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  49.05 
 
 
374 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  49.05 
 
 
374 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  49.32 
 
 
374 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  48.77 
 
 
374 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  49.05 
 
 
374 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  49.32 
 
 
374 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  47.41 
 
 
374 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  44.11 
 
 
374 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  55.37 
 
 
242 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  37.27 
 
 
380 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.8 
 
 
369 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 
372 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  26.67 
 
 
358 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  26.54 
 
 
359 aa  122  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 
364 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  24.54 
 
 
361 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  24.15 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 
163 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.08 
 
 
205 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  25.88 
 
 
114 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.18 
 
 
145 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  25.88 
 
 
114 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 
142 aa  58.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.33 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  29.94 
 
 
197 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  50 
 
 
143 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 
197 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
235 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  41.79 
 
 
149 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
139 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  46.43 
 
 
149 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.29 
 
 
142 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  45.28 
 
 
146 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.85 
 
 
194 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40 
 
 
210 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 
149 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  46.43 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
192 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
197 aa  55.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  46.43 
 
 
149 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  40.3 
 
 
92 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
183 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
266 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  44.64 
 
 
149 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  39.06 
 
 
144 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 
459 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  48.21 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
170 aa  53.5  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
135 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
107 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
134 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  46.3 
 
 
67 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  35.38 
 
 
186 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 
115 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
395 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  43.4 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
188 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
247 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  37.74 
 
 
262 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.43 
 
 
118 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
147 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 
262 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  28.89 
 
 
301 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
185 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
137 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 
338 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  41.67 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
85 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
191 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 
198 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 
125 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.65 
 
 
272 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 
95 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 
187 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 
231 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
117 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  31.58 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 
180 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>