31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1604 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1604  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  857    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000195543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  50.73 
 
 
438 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  34.71 
 
 
397 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  33.17 
 
 
390 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1040  hypothetical protein  32.12 
 
 
418 aa  202  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582207  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1836  hypothetical protein  29.98 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2569  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.43 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0721  hypothetical protein  26.86 
 
 
391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  28.15 
 
 
369 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3885  hypothetical protein  27.03 
 
 
381 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00209227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2369  hypothetical protein  25.12 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0534  hypothetical protein  26.02 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1833  hypothetical protein  23.81 
 
 
381 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  27.43 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  24.44 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  24.61 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  22.33 
 
 
386 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.97 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.88 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  26.81 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  26.64 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.01 
 
 
349 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40 
 
 
345 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
351 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
345 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  28.24 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  25.21 
 
 
314 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  24.31 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.13 
 
 
343 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 
351 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>