More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1583 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 446 aa  926    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  40.09 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  39.13 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  39.59 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38.37 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  40.5 
 
 		 457 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  39.05 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  39.72 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  39.72 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.34 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  39.49 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  39.03 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.34 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  39.03 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  39.26 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  39.26 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  38.34 
 
 		 454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  36.01 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  37.75 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  38.84 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.02 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  37.3 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  35.96 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  36.01 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  35.78 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  37.73 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  34.5 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  38.84 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  33.64 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  33.64 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  35.46 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  34.24 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  35.49 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  34.58 
 
 		 467 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  35.79 
 
 		 459 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  35.79 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  35.79 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.79 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.79 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  34.89 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  35.57 
 
 		 459 aa  246  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  33.73 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  35.79 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.35 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  32.8 
 
 		 449 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  33.57 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  32.13 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  32.05 
 
 		 470 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  31.17 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  32.55 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  32.35 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  34 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  33.41 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  33.12 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  34 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  32.42 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  34 
 
 		 460 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.79 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  34.92 
 
 		 438 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  30 
 
 		 470 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.41 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  32.84 
 
 		 481 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  31.65 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.1 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.41 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.89 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  32.05 
 
 		 451 aa  216  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.45 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  34.84 
 
 		 488 aa  216  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.3 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  32.62 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  32.96 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  32.81 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.5 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.5 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  34.47 
 
 		 447 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.54 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 468 aa  207  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  32.43 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  30.67 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  34.23 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  33.03 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  30.41 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.57 
 
 		 443 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.78 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.74 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  30.16 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3116  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.5 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0559824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.32 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  30.16 
 
 		 439 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  32.19 
 
 		 470 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.49 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3277  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.27 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  normal  0.0635589 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  31.23 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  32.73 
 
 		 572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  33.65 
 
 		 554 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>