More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1575 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  47.39 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 334 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  32.4 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  32.77 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  32.77 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  32.77 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  32.77 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1795  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00491108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  32.77 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  33.56 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  33.56 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.24 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4429  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353494  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1401  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1336  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.916876  normal  0.272272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4084  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1324  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0420  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0291  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0340  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0324  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  27.93 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0828  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.15 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  29.54 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0953  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0974  transcriptional regulator, LysR family  26.41 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.966458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3390  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1046  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0921  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 343 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0884  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000164987  normal  0.231561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>