More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1508 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 352 aa  729    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  27.57 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  25.42 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  24.39 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2753  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 137 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 137 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 121 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 136 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.4 
 
 		 550 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  22.86 
 
 		 527 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  39.24 
 
 		 137 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  33.71 
 
 		 132 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 137 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  27.94 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 127 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 190 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 127 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  31.37 
 
 		 137 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.24 
 
 		 132 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1700  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 540 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0402908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1744  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 112 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 227 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 124 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.27 
 
 		 711 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.94 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 		 124 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  23.23 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 109 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 113 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 113 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 194 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 144 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  29.7 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.76 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  32.5 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 112 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.04 
 
 		 711 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  22.73 
 
 		 527 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.5 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.34 
 
 		 820 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 144 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 125 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  35.94 
 
 		 132 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 110 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  27.45 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  22.93 
 
 		 1240 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  27.45 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  36.84 
 
 		 103 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  26.36 
 
 		 124 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 130 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 		 108 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 		 144 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 116 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2650  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 123 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.846466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26.36 
 
 		 146 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  35.94 
 
 		 132 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  35.94 
 
 		 132 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 144 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  29.91 
 
 		 189 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 		 153 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  26.27 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0605  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 126 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.245257  normal  0.38785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 106 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  28.71 
 
 		 108 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 113 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  32.14 
 
 		 703 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  30.84 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0342  rhodanese domain-containing protein  29.87 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 107 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.5 
 
 		 130 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  31.03 
 
 		 110 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33.33 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33.33 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.53 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 		 136 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  30.59 
 
 		 137 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.73 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.15 
 
 		 141 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 115 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  33.33 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>