More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1486 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.89 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  56.87 
 
 
225 aa  222  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  51.83 
 
 
226 aa  219  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 
224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.95 
 
 
217 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.68 
 
 
223 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  50 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  49.76 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  47.56 
 
 
225 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 
223 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  56.31 
 
 
237 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
218 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.89 
 
 
218 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  48.61 
 
 
224 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.51 
 
 
224 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.66 
 
 
213 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
224 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  48.61 
 
 
224 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.43 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  49.03 
 
 
225 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  49.54 
 
 
217 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  50.49 
 
 
213 aa  185  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  47.27 
 
 
223 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.27 
 
 
223 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  47.27 
 
 
223 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
217 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 
217 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  48.18 
 
 
224 aa  180  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  49.07 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  50.5 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
221 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
221 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
227 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
235 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 
217 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 
222 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  47.27 
 
 
235 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  49.76 
 
 
213 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.24 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.39 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.93 
 
 
217 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.39 
 
 
221 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 
221 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.26 
 
 
217 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  45.16 
 
 
231 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
221 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 
221 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2337  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.61 
 
 
223 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790204  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 
221 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
221 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.78 
 
 
214 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
221 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  46.6 
 
 
217 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
221 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.57 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
223 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
217 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.05 
 
 
221 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  45.66 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  45.66 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  45.66 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  46.89 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  46.89 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
222 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  46.89 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
225 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  46.89 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  48.36 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  46.98 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  46.51 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  46.51 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  46.51 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  46.51 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  46.51 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  45.12 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
217 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  46.89 
 
 
218 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  47.44 
 
 
217 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  45.21 
 
 
222 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  46.58 
 
 
215 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  47.44 
 
 
217 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>