More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1390 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
167 aa  339  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.65 
 
 
161 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.26 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  40.54 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.84 
 
 
189 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.33 
 
 
158 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 
156 aa  101  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  35.9 
 
 
157 aa  101  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  40.43 
 
 
152 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  40.43 
 
 
153 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  40.43 
 
 
152 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  40.43 
 
 
152 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  41.01 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.35 
 
 
176 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  41.01 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  39.01 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  42.28 
 
 
159 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  41.01 
 
 
153 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  40.82 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  39.86 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  47.17 
 
 
184 aa  98.6  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 
160 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  40 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.42 
 
 
173 aa  97.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  40 
 
 
156 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  40 
 
 
156 aa  97.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  40.44 
 
 
160 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  38.31 
 
 
155 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  35.44 
 
 
163 aa  97.4  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  39.16 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  36.71 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.76 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  38.85 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  41.01 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  38.85 
 
 
143 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  38.97 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  38.97 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40.71 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  43.97 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  40.29 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  37.14 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  41.46 
 
 
154 aa  94.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.58 
 
 
152 aa  94  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.22 
 
 
155 aa  94  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  41.46 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  39.58 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.84 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  39.58 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  40.29 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  35.33 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  39.44 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.5 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  38.73 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.58 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  34.69 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  39.72 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  49.59 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  34.48 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.76 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  43.08 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.24 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  35.95 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  36.55 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  36.43 
 
 
152 aa  91.3  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  38.73 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  36.65 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.5 
 
 
157 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.5 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  36.43 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  38.3 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  39.85 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.76 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  41.32 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.76 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>