More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1386 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 342 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  43.98 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 417 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 417 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 431 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 431 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  44.82 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 431 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 431 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 431 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 431 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 431 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 431 aa  255  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 431 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 431 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  41.52 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 		 424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 		 441 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.77 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.98 
 
 		 418 aa  242  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  42.9 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 427 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 441 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 429 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  43.24 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.71 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  40.3 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 436 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 428 aa  231  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 436 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  40.31 
 
 		 429 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 436 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 436 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 		 431 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 428 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.91 
 
 		 437 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 436 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 439 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  39.61 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  39.61 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  41.02 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 440 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 438 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  35.26 
 
 		 433 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 439 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 		 437 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 439 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.16 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  38.85 
 
 		 437 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  36.67 
 
 		 441 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  39.56 
 
 		 436 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  38.27 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  37.42 
 
 		 418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  36.06 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 426 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 426 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 433 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  37.58 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  37.58 
 
 		 436 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  34.86 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 		 437 aa  209  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>