More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1368 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
255 aa  520  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.73518e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54 
 
 
258 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.6 
 
 
258 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57166e-10 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  53.01 
 
 
255 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  53.39 
 
 
255 aa  269  3e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.98 
 
 
254 aa  265  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.8 
 
 
256 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.39 
 
 
253 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.39 
 
 
253 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.59 
 
 
254 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.59 
 
 
253 aa  254  1e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.72262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.59 
 
 
258 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.79 
 
 
254 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.13417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.05 
 
 
244 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.2 
 
 
244 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  7.38809e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.4 
 
 
246 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.62 
 
 
254 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.6 
 
 
255 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.96284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  221  1e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.45557e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  221  1e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.92664e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  221  1e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.36944e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  221  1e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.45686e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  221  1e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  221  1e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.13687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  220  2e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.45261e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  48.61 
 
 
255 aa  220  2e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.82259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  48.21 
 
 
255 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.90791e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.81 
 
 
255 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  45.02 
 
 
252 aa  211  8e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7357e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.98 
 
 
267 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.7 
 
 
258 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  46.88 
 
 
257 aa  200  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  3.36589e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  46.88 
 
 
257 aa  200  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 
244 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.46 
 
 
240 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  46.94 
 
 
258 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  3.94678e-05  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.37 
 
 
242 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
246 aa  189  3e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 
253 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.37 
 
 
242 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.53 
 
 
242 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.15 
 
 
246 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.26 
 
 
249 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
257 aa  183  2e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.18 
 
 
263 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.98 
 
 
254 aa  178  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.51146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.57 
 
 
244 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.16 
 
 
275 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.62 
 
 
252 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.123515  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  37.16 
 
 
275 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.28 
 
 
270 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  37.16 
 
 
275 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.2 
 
 
264 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.38 
 
 
261 aa  169  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.25 
 
 
277 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  42.45 
 
 
236 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.28 
 
 
272 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.25 
 
 
268 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.7 
 
 
264 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.02 
 
 
275 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  39.51 
 
 
268 aa  164  1e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  40 
 
 
266 aa  164  1e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  39.51 
 
 
268 aa  163  2e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  39.51 
 
 
268 aa  163  2e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.51 
 
 
268 aa  163  2e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.51 
 
 
268 aa  163  2e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  39.51 
 
 
268 aa  163  2e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  45.76 
 
 
272 aa  164  2e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  39.51 
 
 
268 aa  163  2e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  42.13 
 
 
269 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  38.05 
 
 
268 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  38.05 
 
 
268 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.56 
 
 
295 aa  162  5e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  38.05 
 
 
268 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  38.05 
 
 
268 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.87 
 
 
243 aa  162  5e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  38.05 
 
 
268 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.9 
 
 
269 aa  161  8e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.87 
 
 
240 aa  161  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.32 
 
 
248 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.32 
 
 
248 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4007  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  39.92 
 
 
271 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  hitchhiker  5.36443e-08 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
259 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 
268 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.91 
 
 
277 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
300 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  42 
 
 
300 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
300 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.28 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.28 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.28 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.28 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.28 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.56 
 
 
285 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.28 
 
 
341 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.56 
 
 
285 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  43.58 
 
 
255 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0735  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.18 
 
 
277 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  decreased coverage  3.65596e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.28 
 
 
285 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.83 
 
 
288 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>