More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1358 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  53.25 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  55.42 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  51.63 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  54.22 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.39 
 
 
265 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  47.41 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  49.02 
 
 
258 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  51.48 
 
 
263 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  51.65 
 
 
285 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.77 
 
 
253 aa  259  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  49.59 
 
 
262 aa  258  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  49.17 
 
 
265 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  49.17 
 
 
265 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  51.56 
 
 
264 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.21 
 
 
278 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  48.97 
 
 
262 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  49.59 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.16 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  47.97 
 
 
260 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 
254 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.8 
 
 
284 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  49.6 
 
 
262 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  47.81 
 
 
280 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.55 
 
 
281 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
251 aa  248  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  48.13 
 
 
254 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 
251 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.48 
 
 
254 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.48 
 
 
254 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  47.74 
 
 
266 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.38 
 
 
258 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  49.38 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.22 
 
 
286 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  47.33 
 
 
266 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.78 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.34 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  51.23 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.91 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  47.33 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  48.55 
 
 
298 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.35 
 
 
251 aa  241  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  47.33 
 
 
271 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  49.79 
 
 
268 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  47.74 
 
 
273 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  48.4 
 
 
281 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  48.4 
 
 
281 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  47.74 
 
 
273 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  47.97 
 
 
259 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 
276 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.55 
 
 
281 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
255 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.96 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.35 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.96 
 
 
281 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  46.89 
 
 
251 aa  238  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
251 aa  238  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.93 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.89 
 
 
251 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  48.13 
 
 
288 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
251 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
287 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 
251 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  48.13 
 
 
278 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
261 aa  234  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.27 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.12 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 
264 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.24 
 
 
276 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.33 
 
 
292 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 
261 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  45.27 
 
 
261 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  44.75 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.08 
 
 
253 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.67 
 
 
271 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  44.53 
 
 
256 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  50.22 
 
 
276 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.12 
 
 
259 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.9 
 
 
259 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  48.23 
 
 
262 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
308 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  43.72 
 
 
256 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
261 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  42.34 
 
 
264 aa  228  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  48.56 
 
 
263 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.47 
 
 
256 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.53 
 
 
257 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  45.68 
 
 
252 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  43.9 
 
 
245 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.22 
 
 
286 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  47.14 
 
 
269 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  52.79 
 
 
239 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.68 
 
 
260 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.85 
 
 
256 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  43.27 
 
 
259 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  45.67 
 
 
282 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>