More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1342 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  100 
 
 		 370 aa  761    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  47.17 
 
 		 370 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  46.76 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  46.09 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  48.24 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  45.82 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  44.17 
 
 		 389 aa  332  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  45.95 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  42.93 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  45.14 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  45.41 
 
 		 386 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  44.53 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  44.5 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  45.33 
 
 		 377 aa  316  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  43.4 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  43.9 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  42.86 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  43.21 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.21 
 
 		 390 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  45.14 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  41.62 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  43.48 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  40.38 
 
 		 391 aa  295  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  42.74 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  42.23 
 
 		 389 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  41.67 
 
 		 411 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  39.57 
 
 		 392 aa  281  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  43.62 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  41.3 
 
 		 395 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  43.21 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  41.6 
 
 		 851 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  41.55 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  40.32 
 
 		 391 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  40.32 
 
 		 391 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  41.85 
 
 		 395 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  40.32 
 
 		 391 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.18 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.75 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  41.03 
 
 		 395 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  40.05 
 
 		 391 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  42.25 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  39.78 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  39.78 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  39.52 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  39.07 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  39.25 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  39.25 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  44.9 
 
 		 849 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  37.67 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  40.5 
 
 		 811 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.86 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  41.24 
 
 		 378 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  38.81 
 
 		 395 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  39.73 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  38.48 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  39.47 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  40.85 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.78 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  41.91 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  40.67 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.37 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  42.42 
 
 		 844 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  40.32 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.53 
 
 		 395 aa  248  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  37.9 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  40.43 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  38.2 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  40.43 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  39.95 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  37.47 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  39.29 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  38.83 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  39.42 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  37.07 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  39.13 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.26 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.26 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  34.82 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  41.28 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.3 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  38.65 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  38.98 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  35.52 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  38.02 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  39.07 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  40 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  37.2 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  38.32 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  37.4 
 
 		 369 aa  222  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  36.31 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  39.43 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  37.81 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  37.74 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  37.37 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>