More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1341 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
521 aa  1042    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  44.17 
 
 
530 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.27 
 
 
515 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  40.69 
 
 
517 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.66 
 
 
519 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.23 
 
 
517 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.42 
 
 
530 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.35 
 
 
525 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.42 
 
 
510 aa  346  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.06 
 
 
516 aa  342  8e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.14 
 
 
532 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 
514 aa  324  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.76 
 
 
513 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 
520 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.77 
 
 
521 aa  317  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.31 
 
 
521 aa  316  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.89 
 
 
524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  39.32 
 
 
519 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.86 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  38.86 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
524 aa  301  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.31 
 
 
524 aa  301  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.62 
 
 
519 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.7 
 
 
533 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  38.45 
 
 
522 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.02 
 
 
509 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  31.61 
 
 
499 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.58 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.27 
 
 
500 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  31.89 
 
 
499 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  34.29 
 
 
524 aa  280  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.84 
 
 
524 aa  279  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.96 
 
 
498 aa  276  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  37.38 
 
 
512 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  37.22 
 
 
512 aa  267  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
511 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.23 
 
 
528 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.54 
 
 
511 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
501 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.86 
 
 
518 aa  256  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.15 
 
 
506 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.04 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.11 
 
 
504 aa  254  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.91 
 
 
490 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 
493 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  34.31 
 
 
490 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.7 
 
 
533 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.58 
 
 
516 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.18 
 
 
492 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 
499 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  37.31 
 
 
506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.05 
 
 
510 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.25 
 
 
510 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.25 
 
 
515 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.05 
 
 
515 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  37.07 
 
 
502 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  33.86 
 
 
515 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  33.86 
 
 
515 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  33.86 
 
 
515 aa  236  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  33.86 
 
 
515 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  37.47 
 
 
436 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  33.98 
 
 
510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.83 
 
 
513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  34.12 
 
 
503 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.13 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.5 
 
 
501 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.87 
 
 
479 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.8 
 
 
511 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  35.07 
 
 
499 aa  233  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.27 
 
 
514 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.15 
 
 
499 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.89 
 
 
515 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.74 
 
 
556 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.35 
 
 
556 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.17 
 
 
512 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.19 
 
 
514 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.85 
 
 
492 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.58 
 
 
492 aa  226  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  36.55 
 
 
502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 
567 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  36.28 
 
 
499 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  40.27 
 
 
509 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.03 
 
 
523 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.74 
 
 
502 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 
499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  36.63 
 
 
487 aa  220  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
499 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.96 
 
 
513 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  34.73 
 
 
514 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 
494 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
499 aa  217  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  34.73 
 
 
514 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  34.73 
 
 
514 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  34.73 
 
 
514 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  34.73 
 
 
514 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  32.81 
 
 
504 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 
518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  33.65 
 
 
494 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>