More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1339 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 426 aa  872    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  55.56 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  55.18 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  48.71 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  49.39 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  41.61 
 
 		 578 aa  316  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  43.58 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  44.34 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  41.67 
 
 		 568 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  40.22 
 
 		 576 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  37 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  36.66 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  36.26 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  36.66 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  36.66 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  36.26 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  36.49 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  36.66 
 
 		 589 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  36.66 
 
 		 589 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  39.28 
 
 		 580 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  35.9 
 
 		 591 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  40.6 
 
 		 587 aa  257  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  35.4 
 
 		 603 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  37.75 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  36.3 
 
 		 589 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  39.45 
 
 		 584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  39.45 
 
 		 584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  36.21 
 
 		 591 aa  249  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  37.09 
 
 		 398 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  37.83 
 
 		 568 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  37.93 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  38.25 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  37.43 
 
 		 559 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  38.24 
 
 		 564 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  36.8 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  36.29 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  38.95 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  37.64 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  38.27 
 
 		 576 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  37.36 
 
 		 556 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 565 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  36.52 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  34.46 
 
 		 563 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  35.88 
 
 		 558 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  37.43 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 565 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  33.76 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  36.31 
 
 		 558 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 579 aa  226  6e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  31.97 
 
 		 565 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  35.53 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  36.87 
 
 		 569 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 572 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  37.4 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.2 
 
 		 563 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  37.67 
 
 		 575 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 572 aa  223  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  38.12 
 
 		 560 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  38.12 
 
 		 560 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  35.1 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  35.49 
 
 		 560 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  35.49 
 
 		 560 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.84 
 
 		 563 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  35.92 
 
 		 577 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  34.69 
 
 		 566 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  33.33 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  37.57 
 
 		 560 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  36.94 
 
 		 565 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  37.16 
 
 		 565 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  37.16 
 
 		 565 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  35.73 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  37.16 
 
 		 565 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  37.16 
 
 		 565 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  37.57 
 
 		 560 aa  216  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 561 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  32.27 
 
 		 558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  35.25 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  37.64 
 
 		 560 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  35.45 
 
 		 566 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  34.54 
 
 		 561 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 		 562 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 561 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  35.11 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  34.26 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>