More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1298 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.2 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.1 
 
 
251 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.17 
 
 
254 aa  290  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.14 
 
 
258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.27 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.91 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.91 
 
 
251 aa  281  9e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.13 
 
 
264 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  58 
 
 
258 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.44 
 
 
251 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.44 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.88 
 
 
248 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.58 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.25 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.25 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.5 
 
 
248 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.6 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.85 
 
 
257 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.85 
 
 
257 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.63 
 
 
257 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.73 
 
 
261 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.73 
 
 
261 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
244 aa  256  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.18 
 
 
258 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  251  6e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.41 
 
 
254 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
250 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  249  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.38 
 
 
255 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.51 
 
 
252 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
867 aa  243  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
260 aa  241  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
252 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.99 
 
 
610 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.39 
 
 
626 aa  238  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.82 
 
 
626 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 
614 aa  236  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.49 
 
 
256 aa  236  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
256 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.39 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.45 
 
 
257 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.66 
 
 
267 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.54 
 
 
958 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  49.2 
 
 
271 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 
257 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  52.91 
 
 
243 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  44 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.58 
 
 
262 aa  219  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.29 
 
 
272 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 
261 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.8 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.51 
 
 
287 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.13 
 
 
275 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.19 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  49.58 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.74 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0146  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.63 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.448492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.01 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  50 
 
 
240 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.85 
 
 
281 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.58 
 
 
253 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  47.98 
 
 
250 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  49.37 
 
 
237 aa  208  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 
262 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.6 
 
 
262 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.51 
 
 
273 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  48 
 
 
280 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.53 
 
 
274 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  46.77 
 
 
250 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 
248 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.67 
 
 
257 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 
269 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 
259 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 
257 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.94 
 
 
253 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 
261 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.7 
 
 
305 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.63 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.85 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.35 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  45.99 
 
 
241 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.32 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.45 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.16 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.94 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 
257 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.72 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.04 
 
 
243 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 
598 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 
251 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.99 
 
 
241 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>